GMail e Facebook são dois webapps; Aplicativos para web. Eles só funcionam através de um navegador. Até existem alguns programas que são capazes fazer interface com os mais populares webapps, contudo, tê-los num ícone na Dock como uma aplicação real é mais prático, não é?
O Fluid é capaz de fazer isto. Você instala ele no seu Mac e é capaz de transformar qualquer webapp em aplicação. No caso de alguns webapps também tem opção de notificações como nos demais apps nativos do OS X. Veja abaixo a apresentação do Fluid e saiba que existem duas versões para você baixar. A primeira é grátis e a segunda custa 5 doletinhas.